1941
Начало войны. Волков встречал на вокзале эшелоны с эвакуированными, оказывал помощь семьям художников. Присвоение звания Заслуженного деятеля искусств.

1942—1944
Участвовал в выставках, в 1944 году открыл свою персональную выставку. К этому времени относятся такие работы, как Цветы, Переход через ручей, Ремесленники старой Бухары, многое другое.

1944—1946
В эти годы Волков избирается председателем живописной секции, членом президиума и правления СХ. Преподает в Ташкентском художественном училище. Награждается медалью «За трудовую доблесть».

1946
Ему присваивается звание народного художника Узбекистана. Пишет автопортрет Мне шестьдесят лет. Практически сразу после присвоения звания вышли ждановские постановления о журналах «Звезда» и «Ленинград», началась кампания по обвинению Волкова в формализме, приведшая к полной изоляции художника.

1949
Начинается борьба с космополитизмом. Волков уходит со всех постов в Союзе художников, а его картины постепенно исчезают из экспозиции Ташкенского музея искусств.

1946—1956
Десять лет работы. Создаются портреты Михаила Врубеля, Владимира Маяковского, Портрет старика Шашлова, серия пейзажей-воспоминаний.

1956
Правление СХ изолирует художника, ограждая приезжающих от встреч с Волковым, ссылаясь на его болезнь, либо заявляя, что он ничего не пишет. Тем не менее, в каждый приезд в Ташкент художника навещают его коллеги С. Чуйков, В. Яковлев, скульптор О. Мануйлова.

1956—1957
После десяти лет забвения в залах СХ Узбекистана проходит «Выставка произведений Народного художника Узбекистана А. Волкова. 70 лет со дня рождения, 50 лет творческой деятельности». После выставки несколько работ были приобретены Ташкентским музеем, но, несмотря на это, правление СХ старалось избегать любых упоминаний его имени.

17 декабря 1957
Александр Николаевич Волков скончался. Памятник на могиле Боткинского кладбища в Ташкенте был поставлен на средства семьи. Автором бюста из бетона стал младший сын художника, молодой скульптор Александр Волков.